Standar penjaminan mutu internal S2 dan S3 pada hakikatnya merupakan rambu-rambu pengelolaan sebagai standar minimal yang harus dicapai dalam pengelolaan jenjang Magister dan Doktor. Pedoman ini sifatnya masih umum dan program studi bisa menambahkan aspek-aspek yang dipandang penting sesuai kekhasan dan kekuatan sumber daya manusia (resources) yang tersedia di masing-masing program studi dalam meningkatkan ketercapaiannya.